Tecniche di sequenziamento dei geni (NGS) applicate alla CMT
Il Next Generation Sequencing (NGS) permette di analizzare un elevato numero di geni su più pazienti contemporaneamente.
Tramite questo apparecchio si può risalire all’intero patrimonio genetico di un individuo ottenendo una diagnosi più rapida.
La CMT può essere soggetta a mutazioni di oltre 70 geni, e grazie al NGS si ha un importante abbattimento dei costi, sempre elevati quando si parla di ricerca.
La mole di dati generata è enorme e pertanto occorre:
- Un lavoro di interpretazione per individuare le varianti genetiche alla base della patologia
- La validazione del risultato ottenuto tramite le tecnologie classiche
Il nostro laboratorio si serve di questa tecnologia da dicembre 2017, grazie ai fondi ricevuti a sostegno della ricerca.
Geni e CMT
Il nostro primo approccio è stato quello di utilizzare un “pannello di geni”. La nostra analisi non si estende all’intero genoma, ma si concentra su un gruppo specifico di geni.
In particolare il nostro pannello contiene 55 diversi geni implicati nella patogenesi della Malattia di Charcot-Marie-Tooth e delle neuropatie ereditarie motorie distali.
Analisi genetiche sulle famiglie alla ricerca dei geni cmt
Abbiamo deciso di utilizzare l’NGS su famiglie prive di diagnosi genetica e che erano già state testate e risultate negative a diversi geni CMT frequentemente analizzati nel nostro laboratorio.
L’esperimento è ancora in corso ma ad un primo livello di analisi la diagnosi molecolare sembra raggiunta in 6 pazienti. Alcuni di loro potranno finalmente ottenere la definizione molecolare della loro neuropatia dopo anni di attesa.
Nonostante i primi buoni risultati è ancora necessario l’estensione della ricerca per poter arrivare all’identificazione di geni ad oggi non ancora noti.
Un lavoro in continuo movimento ed evoluzione.
COMITATO SCIENTIFICO
Dr. Emilia Bellone
Biologo genetista
mail ebellone@unige.it
Prof. Paola Mandich
Medico genetista
mail pmandich@unige.it
Dr. Marina Grandis
Medico neurologo
mail mgrandis@neurologia.unige.it
Progetti in corso
Articoli scientifici - 2013
Articoli scientifici commentati dalla Prof. Paola Mandich
Genetic Workup for Charcot-Marie-Tooth Neuropathy
A retrospective single site experience covering 15 years
Neurological Update: hereditary neuropathies
Caroline Kramarz – Alenxander M. Rossor review
