Tecniche di sequenziamento dei geni (NGS) applicate alla CMT

Il Next Generation Sequencing (NGS) permette di analizzare un elevato numero di geni su più pazienti contemporaneamente.

Tramite questo apparecchio si può risalire all’intero patrimonio genetico di un individuo ottenendo una diagnosi più rapida.

La CMT può essere soggetta a mutazioni di oltre 70 geni, e grazie al NGS si ha un importante abbattimento dei costi, sempre elevati quando si parla di ricerca.

La mole di dati generata è enorme e pertanto occorre:

  • Un lavoro di interpretazione per individuare le varianti genetiche alla base della patologia
  • La validazione del risultato ottenuto tramite le tecnologie classiche

Il nostro laboratorio si serve di questa tecnologia da dicembre 2017, grazie ai fondi ricevuti a sostegno della ricerca.

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Geni e CMT

Il nostro primo approccio è stato quello di utilizzare un “pannello di geni”. La nostra analisi non si estende all’intero genoma, ma si concentra su un gruppo specifico di geni.

In particolare il nostro pannello contiene 55 diversi geni implicati nella patogenesi della Malattia di Charcot-Marie-Tooth e delle neuropatie ereditarie motorie distali.

Analisi genetiche sulle famiglie alla ricerca dei geni cmt

Abbiamo deciso di utilizzare l’NGS su famiglie prive di diagnosi genetica e che erano già state testate e risultate negative a diversi geni CMT frequentemente analizzati nel nostro laboratorio.

L’esperimento è ancora in corso ma ad un primo livello di analisi la diagnosi molecolare sembra raggiunta in 6 pazienti. Alcuni di loro potranno finalmente ottenere la definizione molecolare della loro neuropatia dopo anni di attesa.

Nonostante i primi buoni risultati è ancora necessario l’estensione della ricerca per poter arrivare all’identificazione di geni ad oggi non ancora noti.

Un lavoro in continuo movimento ed evoluzione.

COMITATO SCIENTIFICO

U.O.C. di Genetica Medica Dipartimento di Neuroscienze, Oftalmologia e Genetica IRCCS Azienda Ospedaliera Universitaria S. Martino Viale Benedetto XV 6 16132 GENOVA - ITALIA

Dr. Emilia Bellone 
Biologo genetista 
mail ebellone@unige.it

Prof. Paola Mandich
Medico genetista
mail pmandich@unige.it

Dr. Marina Grandis 
Medico neurologo
mail mgrandis@neurologia.unige.it

Progetti in corso

Progetto CNV

Copy Number Variations (CNVs) nelle malattie ereditarie

Progetto HSPB1

Estensione dell’analisi molecolare del gene HSPB1

Articoli scientifici - 2013

Articoli scientifici commentati dalla Prof. Paola Mandich

Pubblicazioni scientifiche

Prodotte dal nostro Comitato Scientifico

Hereditary motor neuropathies - M. Frasquet and T. Sevilla

Review 2022

Genetic Workup for Charcot-Marie-Tooth Neuropathy

A retrospective single site experience covering 15 years

Neurological Update: hereditary neuropathies

Caroline Kramarz – Alenxander M. Rossor review

Parkinsonism and related disorders

What is hidden behind an axonal neuropathy?